PHP zamknie wszystkie otwarte pliki i połączenia z bazą danych na końcu skryptu. Dobrą praktyką jest robienie tego ręcznie, gdy skończysz z połączeniami, ale nie będzie to katastrofą, jeśli tego nie zrobisz. Jeśli masz połączenie z bazą danych, które będzie używane przez cały skrypt, możesz równie dobrze pozostawić je otwarte.
+1 na PDO