Zawsze używaj Load Data Infile
jako pierwsza próba dla ogromnych zestawów danych.
Strona podręcznika Mysql na Wczytaj plik danych .
Zapisałem kilka odpowiedzi na to pytanie, ale dla porównania, zobacz pytanie tego gościa i moją Odpowiedź i jego porównania czasowe Workbencha z ładowaniem pliku danych.