nie można połączyć się z bazą danych mysql w Ubuntu

Błąd jest bardzo jasno wyjaśniony w komunikacie ostrzegawczym, ignoruje on twój my.cnf .

Spróbuj wykonać następujące czynności, a następnie ponownie uruchomić serwer

chown mysql:mysql /etc/mysql/my.cnf
chmod 600 /etc/mysql/my.cnf

To ustawi właściciela pliku na mysql i uprawnienia 600 da tylko użytkownikowi mysql dostęp do odczytu i zapisu do pliku, uniemożliwi to dostęp wszystkim innym użytkownikom.