Wygląda na to, że wyrzuca to po przekroczeniu limitu czasu. Jest naprawiony błąd, który NIE robi tego, więc jeśli to naprawili, teraz tak się dzieje.
connector-net-en.a4.pdf (dokumentacja MySQL)
MySQL Connector/NET nie zgłosił wyjątku EndOfStreamException, gdy przekroczono net_write_timeout.(Bug #53439)