strtotime
konwertuje go na uniksowy znacznik czasu. NIE reprezentuje sześciu godzin. Reprezentuje dzisiaj 6 rano. Powinieneś pracować z sekundami:
$duration = '06:00:00';
$duration_array = explode(':', $duration);
$length = ((int)$duration_array[0] * 3600) + ((int)$duration_array[1] * 60) + (int)$duration_array[2];
$target = $length + time();