Możesz użyć bezpiecznego połączenia z MySQL:
Strona MySQL:http://dev.mysql.com/ doc/refman/5.5/en/secure-connections.html
Strona PHP:http://php.net/manual/en/mysqli. real-connect.php (Flaga MYSQLI_CLIENT_SSL)
Nie pracowałem z połączeniami SSL do MySQL z PHP, ale myślę, że nie jest trudno znaleźć potrzebne informacje na http:// php.net , http://dev.mysql.com i http://google.com
Aktualizacja
To może pomóc:http://www.madirish.net/node/244 , Połączenia PHP do MySQL SSL , http://www.php.net/manual/en/ mysqli.ssl-set.php