Wstawianie wielu wartości tablicowych do bazy danych mySQL

Nie inicjujesz $frienduserarray jako tablica, więc array_push nie działa.

$friendarray = explode(",", $friendslist);
$frienduserarray = array();

for ($n = 0; $n < count($friendarray); $n++) {
      $friendidpush = "('".$id."','".$friendarray[$n]."'),";
      array_push($frienduserarray, $friendidpush);
}

Zauważ, że wydaje mi się to komplikować sprawy. Dlaczego druga tablica jest nawet potrzebna? Po prostu użyj konkatenacji ciągów.

$query = "INSERT INTO UserLinks (User_1, User_2) VALUES ";
$friendarray = explode(",", $friendslist);

foreach ($friendarray as $friend) {
    $query .= "('" . $id . "','" . $friend . "'),";
}

$query = substr($query, 0, -1); // remove trailing comma

mysql_query($query);