Wygląda na to, że link do problemu z githubem pod warunkiem, że poprawka. Rozwiązaniem, przynajmniej w mojej sytuacji, było ustawienie MaxIdleConnections do 0. Utrzymałem serwer przez 24 godziny, uruchamiając zapytania co kilka godzin i jeszcze nie odtworzyłem błędu.
Dzięki @city za link.