Ponieważ patrzysz na dość równą mieszankę ruchu odczytu/zapisu, InnoDB jest lepszym wyborem. Blokady pełnego stołu MyISAM przy każdym zapisie prawdopodobnie byłyby morderstwem. MyISAM wypada lepiej w przypadku 90%+ odczytu lub 90%+ pisania.
Uważam, że jest to wspomniane w Wysokiej wydajności MySQL
