Ups... chyba go znalazłem...
Muszę tylko launchctl unload -w ~/Library/LaunchAgents/homebrew.mxcl.mysql.plist .
To znaczy, nie wyładowałem go przed rm -rf /usr/local , więc po ponownej instalacji brew i mysql uruchomi się automatycznie, co uniemożliwia wykonanie mysql_install_db ...
btw, ten link również okazał się bardzo pomocny:Jak zatrzymać MySQL w instalacji Mac OS?