Nie zapisujesz zmiennej $imagename w tablicy $files, po prostu ją resetujesz za każdym razem.
$files[$i][$k] = $v;
$imagename = $_POST['keyword'][$i];
Powinno być coś takiego:
$files[$i][$k] = array($v, $_POST['keyword'][$i]);
...
foreach ($files as $data) {
list($file, $imagename) = $data;
...
}