Użyj funkcji UNIX_TIMESTAMP.
SELECT (UNIX_TIMESTAMP(mydate)*1000) FROM...
UNIX_TIMESTAMP da ci sekundy i musisz pomnożyć przez 1000, aby uzyskać milisekundy.
Aby przekonwertować z powrotem, użyj funkcji FROM_UNIXTIME().
SELECT FROM_UNIXTIME(date_in_milliseconds/1000) FROM ...
Ponownie, musisz podzielić przez 1000, aby uzyskać liczbę sekund przed użyciem funkcji.