Zajrzyj do Ten post w InnoDB trzeba wykonać pełny skan tabeli, gdzie podobnie jak w MyISAM jest to odczyt indeksu.
Jeśli używasz where aczkolwiek zmienia wzorzec wykonania tak, aby używał indeksów, więc ogólnie InnoDB będzie wolniejszy niż MyISAM przy pełnych, nieograniczonych liczbach, gdzie wydajność dorównuje przy ograniczonych liczbach.
