Utwórz AUTO_INCREMENT
w nowej tabeli i pomiń je na liście wartości:
CREATE TABLE NEW_TABLE (id INT NOT NULL AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY, col1 …, col2 …, …);
INSERT
INTO new_table (col1, col2, …)
SELECT col1, col2
FROM old_table_1
UNION ALL
SELECT col1, col2
FROM old_table_2
UNION ALL
…