Zapytanie o obliczenie odległości utknęło w PostgresDB

dla wydajności powinieneś dodać te indeksy

    create index idx1 on dots (site_id, dist_from_site,  geom);

    create index idx2 on sites (site_id, geom);

dla drugiej aktualizacji spróbuj dodać również ten indeks

 create index idx3 on dots ( geom, latitude, longitude);