pobieranie danych z dwóch tabel w mysql, tutaj nie działałoby join

Jeśli dobrze zrozumiałem, powinno to zrobić to, czego potrzebujesz:

$result = mysql_query("SELECT (specName, (IF EXISTS (SELECT * FROM user_specialty us WHERE s.id = us.sid AND us.uid = '$id' LIMIT 1))) FROM specialities s;");
while (list($spec, $checked) = mysql_fetch_array($result)) {
    // Do your outputting here.
}

Edytuj

Na twoją prośbę przejdę dalej i wyjaśnię zapytanie. Częścią, która prawdopodobnie Cię myli, jest to podzapytanie:

(IF EXISTS (SELECT * FROM user_specialty us WHERE s.id = us.sid AND us.uid = '$id' LIMIT 1))

IF EXISTS mówi MySQL, aby zwrócił TRUE lub FALSE, jeśli część bezpośrednio po niej 'istnieje' (zawiera wynik). SELECT * FROM user_specialty us WHERE s.id = us.sid AND us.uid = '$id' LIMIT 1 po prostu mówi MySQL, aby znalazł wiersz w user_specialty gdzie s.id = us.sid (dopasowany identyfikator specjalizacji) i us.uid = '$id' (identyfikator należy do użytkownika).