Oświadczenie MariaDB LIMIT przynosi więcej niż limit

Twoje zapytanie zwraca tylko 1 wiersz, czyli mniej niż 3500.

Jeśli chcesz ograniczyć liczbę liczonych wierszy, musisz umieścić to w podzapytaniu.

SELECT COUNT(*)
FROM (
    SELECT 1
    FROM registrations
    WHERE selectedtime IS NULL AND expirationtime < NOW()
    LIMIT 3500) AS x