Zapytanie o relację wiele-do-wielu za pomocą Doctrine z Symfony2

Możesz napisać zapytanie dołączenia DQL jak poniżej

$em = $this->getContainer()->get('doctrine')->getManager();
$repository = $em->getRepository('YourNamespaceYourBundle:User');
$query = $repository->createQueryBuilder('u')
    ->innerJoin('u.groups', 'g')
    ->where('g.id = :group_id')
    ->setParameter('group_id', 5)
    ->getQuery()->getResult();

Twoje mapowanie dla groups właściwość w User podmiot sam zajmie się częścią łączenia, nie musisz wymieniać tabeli połączeń w zapytaniu DQL