Nie możesz uzyskać dostępu do CTE poza całym zestawieniem. I nie masz dostępu do poszczególnych części CTE poza końcowym SELECT dla CTE.
Musisz umieścić całość CTE (łącznie z końcową instrukcją SELECT) do pętla kursora:
FOR R IN (WITH TMP1 AS (.....),
TMP2 AS (......),
TMP3 AS (......)
SELECT DISTINCT .....
FROM TMP1
JOIN temp2 ON ...
JOIN temp3 ON ...
WHERE .....)
LOOP
-- here goes the code that processes each row of the query
END LOOP;