Policz liczbę wartości na identyfikator

Wykonaj GROUP BY , użyj COUNT (który liczy tylko wartości inne niż null):

select id,
       count(value1) as value1,
       count(value2) as value2,
       count(value3) as value3
from table1
group by id

Edytuj :

Jeśli wartości nie są null, ale '.' (lub coś innego), użyj case wyrażenia do warunkowego liczenia, coś takiego:

select id,
       count(case when value1 <> '.' then 1 end) as value1,
       count(case when value2 <> '.' then 1 end) as value2,
       count(case when value3 <> '.' then 1 end) as value3
from table1
group by id