Miałem ten sam problem na Arch Linux. Myślę, że nie jest to problem zależny od systemu operacyjnego. W każdym razie naprawiłem to, znajdując przestarzałe pakiety i aktualizując je.
pip uninstall psycopg2
pip list --outdated
pip install --upgrade wheel
pip install --upgrade setuptools
pip install psycopg2
mam nadzieję, że to pomoże...