Powinieneś spojrzeć na rozszerzenia dostarczane z SQLAlchemy <=0.6:
http://www.sqlalchemy.org/docs/06/orm/interfaces.html
Są haczyki, w które możesz wkleić swój kod dla poszczególnych operacji.
SQLAlchemy 0.7+ ma teraz system zdarzeń... może być coś podobnego. Zobacz
http://www.sqlalchemy.org/docs/core/events.html