Czy lepiej zrobić equi łączyć w klauzuli from czy klauzula where?

Ogólnie rzecz biorąc, nie ma to znaczenia semantycznego.

Jest jednak jeden skrajny przypadek, w którym może to zrobić. Jeśli (przestarzałe) GROUP BY ALL konstrukcja zostanie dodana do zapytania, jak pokazano poniżej.

DECLARE @A TABLE(A_ID INT, DURATION DECIMAL(3,2) )
INSERT INTO @A VALUES(1,2.00)

DECLARE @B TABLE(A_ID INT)
INSERT INTO @B VALUES(1)

/*Returns one row*/
SELECT *
FROM @A A
INNER JOIN @B B ON A.A_ID = B.A_ID
WHERE A.DURATION = 3.00
GROUP BY ALL A.A_ID, A.DURATION, B.A_ID

/*Returns zero rows*/    
SELECT *
FROM @A A
INNER JOIN @B B ON A.A_ID = B.A_ID  AND A.DURATION = 3.00
GROUP BY ALL A.A_ID, A.DURATION, B.A_ID