Hibernacja (/JPA) stronicowania po stronie serwera i MS SQL Server

Trochę spóźniona odpowiedź, ale może być pomocna, więc ją opublikuję. Miałem dokładnie ten sam problem i ból głowy, żeby go wyśledzić. Rozwiązaniem jest użycie org.hibernate.dialect.SQLServer2012Dialect który jest zawarty w Hibernate 4.3.0. Wygenerowane zapytanie staje się (wklejenie prawdziwego zrzutu Hibernate bez nazw kolumn i aliasów):

WITH query 
     AS (SELECT inner_query.*, 
                Row_number() 
                  OVER ( 
                    ORDER BY CURRENT_TIMESTAMP) AS __hibernate_row_nr__ 
         FROM   (SELECT TOP(?) <COLUMN_NAMES> AS <ALIASES>
FROM <TABLE_NAME>
) inner_query) 
SELECT <ALIASES>
FROM   query 
WHERE  __hibernate_row_nr__ >= ? 
       AND __hibernate_row_nr__ < ?

Zwróć uwagę na użycie wewnętrznego zapytania i Row_number() funkcjonować. W końcu to rozwiązali!