Spóźniona odpowiedź, ale może być przydatna dla odwiedzających wątek
Poza innymi wymienionymi rozwiązaniami, sugeruję wypróbowanie ApexSQL Data Diff. Może porównywać i synchronizować dane bazy danych SQL Server (w żywych bazach danych i kopiach zapasowych) oraz automatyzować i planować migracje danych. Działa również z ogromnymi bazami danych i jest w stanie przeprowadzać porównania bezpośrednio z SSMS.
Możesz pobrać to narzędzie za darmo i bawić się nim. Zawiera w pełni funkcjonalną bezpłatną wersję próbną i oferuje edycję społecznościową (po zakończeniu okresu próbnego), która działa na SQL Express i Azure SQL Database.
Aby dowiedzieć się więcej o narzędziu, odwiedź http://www.apexsql.com/sql_tools_datadiff.aspx