CZY ALTER jest blokowany przez współdzielone blokady metadanych utrzymywane przez inne instrukcje? Każda ALTER wymaga blokady na wyłączność metadanych i jako taka zostanie zablokowana przez każdą inną instrukcję używającą tabeli.
Sprawdź Monitor aktywności lub zajrzyj do sys.dm_exec_requests i zobacz, kto blokuje ALTER INDEX.