Mongo DB znajduje wszystkie rekordy o najwyższej wartości w zależności od pola kluczowego

Tak, ale podejście jest nieco inne:

db.myCol.aggregate([
    {$sort: {value:-1}},
    {$group:{
        _id: "$user",
        doc: {$first: "$$ROOT"}
    }},
    {$replaceRoot: {newRoot: "$doc"} }
])