MongoDB 3.2 (wydana w listopadzie 2015 r.) oferuje szyfrowany silnik pamięci masowej. Nie ma potrzeby korzystania z zewnętrznych interfejsów API do szyfrowania danych przed włożeniem lub zaszyfrowaniem całego dysku. Więcej szczegółów znajdziesz tutaj. Należy jednak pamiętać, że jest on oferowany tylko w wersji Enterprise.
Współpracuje z silnikiem pamięci masowej WiredTiger, który od wersji 3.0 jest dołączany jako alternatywa dla domyślnego silnika pamięci masowej MMAPv1. Jeśli Twoja baza danych nadal używa MMAPv1, przeczytaj ten przewodnik, aby dowiedzieć się, jak przekonwertować bazę danych z MMAPv1 na WiredTiger.
Jak zauważył Fernando Paz w komentarzach, zaszyfrowana pamięć masowa jest dostępna tylko w wersji MongoDB Enterprise.