Możesz użyć tej struktury.Struktura API mongoose.model jest następująca:
Mongoose#model(name, [schema], [collection], [skipInit])
co oznacza
mongoose.model('User', AdminSchema, 'admin');
//Here 3rd argument 'admin': as collection name
Z tym też możesz zrobić
let AdminSchema = mongoose.Schema({
username : String,
password : String.
.......
}, { collection: 'admin' });
Zobacz ten link z dokumentacji Mongoose.