Może być konieczne użycie atrybutu Bson w swojej nieruchomości w ten sposób.
[BsonId]
[BsonRepresentation(BsonType.ObjectId)]
public string Id { get; set; }
W tym pytaniu, na które udzielono odpowiedzi, jest całkiem dobre wyjaśnienie tych atrybutów
BsonId a BsonRepresentation