Nie jestem pewien, czy to właściwy sposób, wysłanie zabójstwa może prawdopodobnie spowodować uszkodzenie serwera mongo, a po awarii będziesz musiał naprawić bazę danych.
Może już rozwiązałeś to pytanie, ale oto co robię :
mongo admin --eval "db.shutdownServer()"
Automatycznie łączę się z kolekcją administratora, a następnie muszę tylko uruchomić wygaszanie.
Oto oficjalny link o tym, jak prawidłowo zatrzymać Mongodb:http://api.mongodb.org/wiki/current/Starting%20and%20Stopping%20Mongo.html
Najlepsze