Ponieważ mongodb objectId zawiera datę utworzenia, możesz sortować według id, malejąco, a następnie użyć limit(1):
db.collection.find().sort( { _id : -1 } ).limit(1);
Uwaga:nie znam w ogóle node.js, powyższe polecenie to polecenie powłoki mongo i przypuszczam, że możesz łatwo przepisać je do node.js.