Ja również spotkałem się z tym samym problemem.
Sprawdź, czy używana wersja Mongoose obsługuje wersję serwera MongoDb
Sprawdź zgodność pod tym linkiem:http://mongoosejs.com/docs/compatibility.html
Zmień odpowiednio wersję Mongoose w pliku package.json.
Mam nadzieję że to pomoże!
