MongoDB filtruje zawartość tablicy obiektów na podstawie członka obiektu

Możesz porównać qTyIn z undefined w obrębie $filter :

db.collection.aggregate([
    {
        $addFields: {
            transactions: {
                $filter: {
                    input: "$transactions",
                    cond: {
                        $ne: [ "$$this.qtyIn", null ]
                    }
                }
            }
        }
    }
])

Plac zabaw Mongo