To jest błąd w Twoim dzienniku.
Więc chyba masz jakieś dane 3.4 w swoim /data/db
.
- Jeśli chcesz czystą instalację, po prostu usuń zawartość
/data/db
i uruchom ponowniemongod
lub
- Zdobądź mongod 3.4
Ref:https://docs.mongodb.com/manual/ release-notes/3.6-upgrade-standalone/