właściwie nie. To polecenie (String) może uruchamiać dowolne polecenia bazy danych mongo, a nie dowolny javascript. Do tego ostatniego potrzebujesz DB.eval(), które zablokuje całą bazę danych, chyba że używasz wersji 1.7.2 mongo lub nowszej i ustawiono opcję noblock.
odniesienia:http://api.mongodb.org/java/2.4-rc0 /indeks.html http://mongodb.onconfluence.com/display/DOCS/List +polecenia+bazy danych
