W rzeczywistości nie potrzebujesz modułu MangoDB dla Kohany, z którym się łączyłeś. Możesz po prostu użyć natywnego sterownika MongoDB PHP. Język zapytań mongo jest dość prosty, jeśli znasz trochę MySQL, ta strona pomoże...
http://www.php.net/manual/en/mongo.sqltomongo .php
Oto przykład użycia sterownika, łączy się, uruchamia i wstawia do nowej kolekcji, a następnie wybiera wszystkie dane w kolekcji...
$m = new Mongo();
$db = $m->my_database;
$db->my_new_collection->insert(array("a" => 1, "b" => 1));
$found_data = $db->my_new_collection->find();
Zobacz więcej na http://www.php.net/manual/en/ mongo.manual.php
Jeśli chcesz korzystać z MangoDB, sugeruję przeczytanie kodu i sprawdzenie na forach kohana informacji na ten temat.
http://forum.kohanaframework.org/search?Search=mangodb