mongo count wierszy z tablicy dostarczonych danych

Jeśli dobrze rozumiem, jesteś tak blisko, sprawdź to zapytanie:

• Pierwsze użycie $match aby uzyskać tylko dokumenty, których subLevel.id to 1 lub 2.
• Wtedy, jak już zrobiłeś, $group przez id i suma, aby uzyskać całkowitą liczbę:

db.collection.aggregate([
  {
    "$match": { "subLevel.id": { "$in": [ 1, 2 ] } }
  },
  {
    "$group": { "_id": "$subLevel.id", "count": { "$sum": 1 } }
  }
])

Przykład tutaj