Aktualizowanie pozycji w tablicy z unikalnym identyfikatorem

Zobacz dokumentację do aktualizacji tablicy. Twój kod powinien wyglądać mniej więcej tak:

serwer

Meteor.methods({
  'content.update.lastModified': function(contentId, peerId) {
    check(contentId, String);
    check(peerId, String);

    var selector = {_id : id, 'Peers.uniquePeer': peerId};
    var modifier = {$set: {'Peers.$.lastModified': 'Now'}};
    Content.update(selector, modifier);
  }
})

klient

Meteor.call('content.update.lastModified', contentId, peerId);

Zwróć uwagę, że tego rodzaju operacja musi odbywać się w metodzie zdefiniowanej przez serwer, ponieważ, jak się dowiedziałeś, możesz aktualizować dokumenty tylko według identyfikatora na kliencie.