Rozwiązałem problem.
Zrobiłem ten dodatkowy etap do potoku:
{$project: {_id:0, "result":{$sum: "$japanese_array.v.value"}}}
Zadałem podobne pytanie 2 dni temu i otrzymałem odpowiedź Jak zsumować wartości w obiekcie, który jest zagnieżdżonym dokumentem podrzędnym w mongodb przy użyciu node.js? pomógł mi znaleźć rozwiązanie tutaj.