Twój plik źródła danych powinien mieć:
"host": "database"
...
ponieważ w docker-compose.yml łączysz kontener mongo z pętlą zwrotną jako database , więc nie jest to localhost . Pamiętaj, że próbujesz połączyć się z mongo z kontenera docker loopback. Powinieneś również upewnić się, że mongo jest uruchamiane przed pętlą zwrotną, więc dodaj depends_on: database do usługi pętli zwrotnej w docker-compose.yml.