Najprawdopodobniej nie masz powodów do zmartwień. Większość pamięci RAM używanej przez mongodb to po prostu pamięć podręczna systemu plików, a system operacyjny ma pełną kontrolę nad tą pamięcią podręczną, tj. może zwolnić pamięć, jeśli jest to wymagane przez inny proces.
Domyślnie w MongoDB 3.4 większe z „256 MB lub 50% minus 1 GB całkowitej pamięci RAM” jest zarezerwowane dla pamięci podręcznej WiredTiger i jest to jedyna część, której system operacyjny nie może zwolnić.
Więc jest mało prawdopodobne, że zobaczysz jakiekolwiek problemy podczas uruchamiania jakichkolwiek zadań cron lub podobnych. Tak długo, jak żaden z twoich procesów nie zostanie zabity przez „zabójcę braku pamięci (OOM), nie zabraknie pamięci RAM.