Przede wszystkim musisz otworzyć punkt końcowy na swoim serwerze. Mongodb jest bazą danych i dlatego możesz uzyskać do niej dostęp ze swojego zaplecza, implementując kontroler lub coś podobnego. Następnie możesz wykonać wywołanie API do tego punktu końcowego.
$scope.del = function(data) {
$http.post('/records/' + data.id + '/delete')
.then(function(){
.... the rest of your angular code goes here
})
};