Użyj
db.system.js.save( { _id : "myDatabaseAverage" , value : function(){
// ..do something
} } );
Spowoduje to zapisanie funkcji JS na serwerze i od tego momentu będzie można uzyskać do niej dostęp przez m/r.
Więcej przykładów znajdziesz tutaj:mongo/mr_stored/core. js