MongoDB Grupuj według pól, policz i posortuj według opisu

Patrząc na zapytanie sql, wygląda na to, że chcesz sortować według liczby. Więc w zapytaniu mongo również powinieneś wspomnieć o countA jako pole sortowania.

db.coll.aggregate([
  {
     $group: { 
        _id: "$mainsubject.code", 
        countA: { $sum: 1}
     }
  },
  {
    $sort:{'countA':1}
  }
])