Najpierw przypisz zapytanie do zmiennej... następnie zlicz tablicę samochodów... jak poniżej
var obj = db.company.find(_id:"5b8ed214b460e7c17c5a33f9").toArray();
var count = obj[0].cars.length
Jeśli znajdziesz według _id obj[indeks], zawsze będzie to 0.