Nie wiem, jak rozwiązać ten problem za pomocą phpMyAdmina, ale istnieją inne narzędzia, które mogą pomóc w osiągnięciu oczekiwanego efektu. Liquibase jest jednym z nich. Używałem go kilka razy w przeszłości i był całkiem niezły. Trochę to zajmie, ale myślę, że może ci to pomóc.