Wydaje się dziwne, że ten katalog nie został utworzony podczas instalacji — czy ręcznie zmieniłeś ścieżkę do pliku gniazda w my.cfg?
Czy próbowałeś po prostu samodzielnie utworzyć ten katalog i ponownie uruchomić usługę?
mkdir -p /var/run/mysqld
chown mysql:mysql /var/run/mysqld
