Mam do czynienia z tym samym problemem co ty, problem pojawia się tylko wtedy, gdy używam Opery lub Chrome.
W moim przypadku mam plik .htaccess aby wskazać wszystko do pliku indeksu. Oczywiście przeglądarka dwukrotnie zażąda skryptu, raz dla samego skryptu, a drugi dla favicon.
Poprawka: Spróbuj edytować .htaccess aby zapobiec przekierowaniu do pliku indeksu, gdy przeglądarka żąda favicon.ico
