Czy usunięcie tabeli w MySQL powoduje również usunięcie indeksów?

Tak, ma.

Jeśli jednak masz ograniczenia klucza obcego, takie jak RESTRICT, które zapewniają referencyjną integralność z innymi tabelami, będziesz chciał usunąć te klucze przed usunięciem lub obcięciem tabeli.